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单链构象多态性(Single strand conformation polymorphism,SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,可以检测出在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中因构象差异而导致的单链DNA片段迁移率的不同。本研究根据棉花基因芯片筛选的纤维发育中差异表达基因设计了162对引物，利用SSCP技术在4个陆地棉品种、4个海岛棉品种中进行多态性检测。结果表明，在162对引物中，146对...
赤霉病主效抗性QTL区域SSCP标记的发掘与验证
小麦 赤霉病 SSCP标记 辅助育种
2011/10/19
为开发简便、高效的小麦抗赤霉病辅助育种的DNA标记，将一个基于ABI DNA序列分析仪、与3BS上赤霉病抗性主效QTL紧密连锁的分子标记转化为简便的SSCP (DNA 单链构象多态性标记，Single Strand Conformational Polymorphism marker) 标记并进行了验证。该SSCP标记可有效区分抗感品种之间的差异。对36个小麦品种进行了基因分型和赤霉病抗性鉴定，在...
五种牛THRSP基因部分第一外显子序列PCR-SSCP多态性研究
THRSP基因 PCR-SSCP 黄牛 分子标记
2009/11/5
THRSP基因是调节动物脂肪生成的重要基因。本试验利用PCR—SSCP和DNA测序方法对秦川牛（QC）、夏南牛（XC）、南阳牛（NC）、郏县红牛（JRC）、鲁西牛(LC）共644头牛的THRSP基因部分第一外显子序列进行遗传多样性分析。结果发现存在两个突变位点：40bpC/T和78bpA/G；四种基因型：AA，AB，BB，AC；五种牛A，B，C基因的频率分布一致。从位点间杂合度来看：QC﹥XC﹥L...
中国荷斯坦牛AGPAT6基因第2内含子PCR SSCP分析
AGPAT6基因 中国荷斯坦牛 PCR SSCP分析
2009/10/10
［目的］ 寻找影响奶牛产奶性能的候选基因。［方法］ 以中国荷斯坦牛为研究对象，采用PCRSSCP方法对AGPAT6基因第2内含子进行单核苷酸多态性检测并分析多态位点对奶牛产奶量、乳脂率、乳蛋白率和乳中体细胞评分的影响。［结果］ 扩增出462 bp的中国荷斯坦牛AGPAT6基因第2内含子；PCRSSCP分析该基因第2内含子有AA、AB和BB 3种基因型，其频率分别为0.151 1、0.6...
蒙古马性格候选基因5HT受体部分序列的PCR SSCP分析
蒙古马 性格候选基因 5-羟色胺受体 多态性
2009/9/2
［目的］ 研究马5HT受体基因与性格性状之间的关系，为优良马匹的鉴定、合理利用与品种改良提供理论基础。［方法］ 首先进行问卷调查，选取60匹蒙古马，采集血样，提取相关DNA，设计引物，然后进行PCR和PCRSSCP分析，最后将问卷调查结果与相关基因多态性结合，对每匹蒙古马性格进行综合评价和统计分析。［结果］ HTR1b基因BB型马在对人友好、协作性、温顺性、忍耐性、合群性方面特征明显，AB...
通过对甘孜藏猪、合作猪、巴马猪以及五指山猪4个群体的SLA-DMA基因第2和第3外显子的PCR-SSCP和序列多态分析表明：SLA-DMA基因的第2外显子没有多态，但第3外显子有2个等位基因的变异。通过优化低离子强度单链构象多态分型条件（LIS-PCR-SSCP）、克隆测序、菌落PCR、菌落不对称PCR及单链DNA二级结构计算机预测等技术，对第3外显子PCR-SSCP复杂带型进行了准确的判定，J等...
山羊生长分化因子9基因外显子2 的PCR-SSCP分析
山羊 高繁殖力 生长分化因子9基因 PCR-SSCP
2008/9/12
目的】寻找与产羔数相关的遗传标记，为山羊高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。【方法】以控制Belclare绵羊和Cambridge绵羊高繁殖力的生长分化因子9（growth differentiation factor 9, GDF9）基因为候选基因，根据绵羊GDF9基因序列设计4对引物，采用PCR-SSCP技术检测GDF9基因外显子2在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)以及低繁殖力山羊品种(波尔山羊...
应用反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）及限制性片段长度多态性（RFLP）和单链构象多态性（SSCP）分析技术，快速检测中国水稻条纹病毒（Rice stripe virus，RSV）RNA4基因间隔区（intergenic region，IR）的变异。IR经RT-PCR扩增后得到一段长约680 bp的片段，RSV 7个分离物之间片段大小相同，应用AIuI、NdeI在它们之间检测到RFLP，其中B...
7个牛品种PON2基因第9外显子SSCP分析及其外显子多态性扫描
牛 PON2基因 PCR-SSCP 多态性
2008/8/21
对氧磷酶2 (Paraoxonase-2, PON2) 产物是脂肪代谢过程中的抗氧化酶，被确定为影响相关重大心血管疾病和人类寿命的重要候选基因。本研究利用直接测序法对 PON2 基因所有外显子进行多态位点扫描，利用PCR-SSCP 技术对中国西门塔尔牛、鲁西牛、秦川牛、晋南牛、荷斯坦牛、摩拉水牛和尼里-拉菲水牛7个品种的478头个体PON2基因第9外显子T98C位点进行多态性分析。结果表明，PON...
绵羊催乳素受体基因PCR-SSCP分析
绵羊 催乳素受体基因 PCR-SSCP
2008/4/9
采用PCR-SSCP技术分析了催乳素受体基因（PRLR）在小尾寒羊、萨福克羊、多赛特羊、多赛特公羊×小尾寒羊母羊F1代杂种羊4个绵羊群体中的多态性。结果表明：PRLR基因在3对引物扩增片段中均存在PCR-SSCP多态性。对于引物1，4个绵羊群体均检测到AA基因型，AB基因型只出现在小尾寒羊、多赛特羊和萨福克羊中，仅在多赛特羊中检测到BB基因型。对于引物2，4个绵羊群体均检测到AA和AB基因型，只有...
马生长激素（GH）基因的PCR-SSCP研究
马 GH 基因 PCR-SSCP 遗传多态性
2008/4/9
选取4个蒙古马地方品种、1个国内培育品种和1个国外引入品种共281匹马，采用PCR-SSCP技术，检测了GH 基因5＇侧翼区、第1内含子、第2外显子和第5外显子4个位点的遗传多态性。结果显示：仅第5外显子出现多态性，表现出AA、BB和AB 3种基因型，其余位点未检测到多态。群体遗传学分析结果表明：除纯血马外，其余品种都是等位基因A为优势基因；Hardy-Weinberg平衡检验显示，乌审马、乌珠穆...
7个牛品种PON2基因外显子多态扫描及第9外显子SSCP分析
牛 PON2基因 PCR-SSCP 态性
2008/3/29
对氧磷酶2(paraoxonase-2, PON2)基因产物是脂肪代谢过程中的抗氧化酶，被确定为影响相关重大心血管疾病和人类寿命的重要候选基因。本项研究对利用直接测序法对PON2基因所有外显子进行多态位点扫描，利用PCR-SSCP技术对中国西门塔尔牛、鲁西牛、秦川牛、晋南牛、荷斯坦牛、摩拉水牛和尼里-拉菲水牛7个品种的478头个体PON2基因第9外显子98（T/C）位点进行多态性分析。结果表明，P...
摘要根据位于小麦第四同源群上与耐盐有关的gf-2.8基因的编码区序列设计1对引物,分别以两个耐盐突变体及其亲本的总DNA为模板进行PCR扩增,在5个供试材料中均扩增出1条约685bp的目的条带。SSCP电泳显示突变体974915与其他供试材料之间存在差异。测序表明冀麦24和其耐盐突变体8901-17的扩增产物序列与gf-2.8基因的发表序列相同,这表明突变体8901-17的突变位点不在该基因上;而...
五指山、二花脸和皮特兰猪的SLA-DRB基因外显子2 PCR-RFLP及PCR-SSCP多态性分析
五指山猪 二花脸猪 皮特兰猪 SLA-II类基因 PCR-RFLP PCR-SSCP
2008/1/26
摘要采用PCR-RFLP法和PCR-SSCP法对17头五指山猪、28头二花脸猪以及28头皮特兰猪SLA-DRB外显子2进行分型。采用PCR-RFLP技术分型，结果显示：限制酶MspⅠ酶切可分出1种RFLP带，即M：143 bp/102 bp；限制酶RsaⅠ酶切可分出4种RFLP带，分别为A：141 bp/93 bp/11 bp，B：111 bp/69 bp/54 bp/11 bp ，C：180 b...