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2020年5月13日,福建省农业科学院畜牧兽医研究所牵头制定的福建省地方标准《鸭巴泰病毒RT-PCR检测方法》审定会在福州召开。会议由福建省市场监督管理局组织,邀请福建省畜牧兽医学会、福建省标准化研究院、福建省畜牧总站、福建师范大学、福州市动物疫病预防控制中心、福建农业职业技术学院和兆丰华生物科技(福州)有限公司7个单位的专家对该标准进行审定。
本试验的目的是建立更加灵敏的检测牛冠状病毒(BCoV)的RT-PCR方法,并对川西北草原牦牛病料进行BCoV病原检测。选择BCoV聚合酶基因Nsp7-Nsp9片段设计引物,通过反应条件和体系优化,建立检测BCoV的RT-PCR方法并应用于临床样本检测。结果显示:所建方法特异性和重复性好,灵敏性达到1×10-2 pg·μL-1;该方法对肉牛和牦牛BCoV都有良好的检测效果,优于比较的两种以BCoV ...
猪丁型冠状病毒(PDCoV)与猪流行性腹泻病毒(PEDV)均为致病性冠状病毒,可以引起猪呕吐、腹泻脱水和新生仔猪死亡。为了建立一种快速检测PDCoV和PEDV的双重SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法,根据GenBank登录的2种病毒基因的保守序列,设计了两对特异性引物,分别扩增其N、M基因保守区,并将其克隆至pMD19-T载体;将10倍梯度稀释的混合重组质粒作为标准品模板,建立了一种...
轮状病毒(rotavirus,RV)VP6基因是RV的主要分子检测靶点,但该基因的点突变会影响RV的分子检测。本试验的目的是在研究牦牛RV VP6基因遗传变异的基础上,建立检测牦牛RV的RT-PCR方法并应用于临床样本检测。采用Prime 5.0设计引物,从30个牦牛腹泻样本中扩增得到14个位于931—1 338 bp牦牛RV VP6基因片段。序列分析结果发现,与牛轮状病毒(bovine rota...
用RT-PCR检测海兰褐蛋鸡禽戊型肝炎病毒
禽戊型肝炎病毒(HEV) 海兰褐蛋鸡 大肝大脾病(BLS) 基因3型
2016/9/21
为证实我国蛋鸡群中存在禽戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV),从患有大肝大脾病的某海兰褐蛋鸡群采集粪便样品40份、血浆样品10份。提取RNA后,进行禽HEV ORF2基因片段的RT-PCR(reverse transcription PCR)检测,阳性样品进行克隆测序。同时采集疑似HEV感染鸡的肝,在两周龄SPF鸡进行了人工接种试验。结果表明,来自海兰褐蛋鸡群的40份粪便和1...
近期作者实验室从腹泻牦牛粪便样本中鉴定出一种新型星状病毒(AstV)——牦牛AstV,本研究旨在建立检测牦牛AstV的RT-PCR方法。首先设计引物扩增牦牛AstV 630 bp的ORF2基因片段,进行序列分析;在此基础上设计检测引物,建立检测牦牛AstV的RT-PCR方法。结果显示,从20份牦牛腹泻粪便中扩增出13个牦牛AstV ORF2基因片段,核苷酸相似性为99.3%~100%,而与牛肠源星...
检测施马伦贝格病毒核酸的荧光定量RT-PCR方法
施马伦贝格病毒 核酸 引物 TaqMan探针 荧光定量RT-PCR
2014/12/26
根据施马伦贝格病毒(Schmallenberg virus,SBV)S基因节段设计一对引物和TaqMan探针,建立了检测SBV核酸的荧光定量RT-PCR方法。通过优化反应体系和反应条件,该方法对101~107半数组织培养感染量(TCID50)的SBV核酸呈现良好的线性关系。利用德国FLI制备和保存的SBV核酸阳性(n=140)、SBV核酸阴性(n=132)和辛波血清群相关病毒核酸样品(n=16),...
旨在建立一种同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪肠道病毒9型(PEV-9)、猪嵴病毒(PKV)的三重RT-PCR法,并初步应用于临床样品检测。根据GenBank中PEDV和 PKV基因序列保守区设计2对引物,参照文献合成1对PEV-9引物,在同一体系进行RT-PCR扩增,对引物浓度、退火温度、灵敏度、特异性等进行优化,应用该法对采自四川省6个猪场46份样品进行检测。结果表明引物量分别为PEDV...
本研究旨在建立猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RTPCRRFLP鉴别检测方法。根据Shimen株设计1对特异性引物,建立猪瘟病毒 RTPCRRFLP检测方法;对20份疑似猪瘟临床样品进行检测,并对检出的山东8株流行野毒株和2株疫苗株PCR产物进行克隆与序列分析,验证上述方法。结果RTPCR扩增片段为825 bp,产物经RFLP分析,野毒株的PCR产物能被ApaⅠ酶切为322 bp和503 ...
旨在建立一种检测马Toll样受体(TLRs)mRNA表达水平的SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR(Rverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)方法。参照GenBank中马TLRs的基因序列保守区设计特异性引物,以马β肌动蛋白(β-actin)mRNA为内参,建立荧光定量RT-PCR方法。结果,扩增曲线在1×102~1×108 copies...
本研究旨在建立猪瘟病毒野毒株和兔化弱毒疫苗株RT-PCR-RFLP鉴别检测方法。根据Shimen株设计1对特异性引物,建立猪瘟病毒 RT-PCR-RFLP检测方法;对20份疑似猪瘟临床样品进行检测,并对检出的山东8株流行野毒株和2株疫苗株PCR产物进行克隆与序列分析,验证上述方法。结果RT-PCR扩增片段为825 bp,产物经RFLP分析,野毒株的PCR产物能被ApaⅠ酶切为322 bp和503 ...
本研究旨在建立猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的一步多重RTPCR检测方法。通过多序列比对以及反应条件的优化,从4对引物中精选了3对特异性和敏感性较好、扩增片段分别为228、345和490 bp的引物,并应用所建立的方法对4种分离株的细胞毒和组织毒、田间样品及临床症状相似的疾病猪瘟和猪伪狂犬病毒做了检测;并对田间及实验室样品进行符合率试验,对阳性样品进行重复性试验。与常规RTPCR法进行比...
本试验旨在建立能同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪A群轮状病毒(GAR)的多重RT-PCR检测方法。根据GenBank收录的PEDV M基因、TGEV N基因、GAR VP7基因,利用软件Primer 5.0设计合成能分别特异性扩增PEDV、TGEV、GAR相应基因的引物。利用这3对引物,作者建立了一种新的能够同时检测PEDV、TGEV和GAR的多重RT-PC...
绵羊MC4R基因的半定量RT-PCR及生物信息学分析
黑素皮质素受体-4 基因克隆 半定量RT-PCR 生物信息学
2013/12/6
本研究旨在对绵羊MC4R基因进行组织表达谱和生物信息学分析。参考牛MC4R基因序列设计引物,采用PCR技术克隆绵羊MC4R基因序列,并利用半定量RT-PCR进行组织表达谱分析;同时对其进行生物信息学分析。结果表明,克隆的绵羊MC4R基因全长1 919 bp,含有999 bp的完整CDS编码区,编码332个氨基酸。其CDS编码区的核苷酸序列与牛、人、猪、大鼠、小鼠MC4R 基因对应序列的同源性分别为...
CSFV和PRRSV二联RT-PCR检测方法的建立
猪瘟病毒 猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒 二联RT-PCR
2011/8/18
参照GenBank中猪瘟病毒(CSFV)和猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)基因保守序列,设计2对特异引物,通过对最佳反应条件的优化,建立了CSFV和PRRSV的二联RT-PCR检测方法,该方法可同时扩增得到2条与试验设计相符的443 bp(CSFV)和246 bp(PRRSV)特异性条带。应用该二联RT-PCR方法检测猪细小病毒(PPV)、猪伪狂犬病毒(PRV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV...