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于典司（2021）Genetic diversity and population structure of popcorn germplasm resources using genome-wide SNPs through genotyping-by-sequencing （图）
爆米花 遗传多样性 SNP 爆裂玉米
2023/2/27
上海市农业科学院作物育种栽培研究所玉米研究中心郑洪建团队在Genetic Resources and Crop Evolution发表了题为“Genetic diversity and population structure of popcorn germplasm resources using genome-wide SNPs through genotyping-by-sequencing...
中国水产科学研究院珠江水产研究所《鉴别尖塘鳢鱼种的SNPs及基于SNPs的AS-PCR引物组及其检测方法及应用》获得国家发明专利授权（图）
鉴别 尖塘鳢鱼种 SNPs AS-PCR引物组 检测方法 专利授权（图）
2021/9/10
日前，由中国水产科学研究院珠江水产研究所水产生物技术室樊佳佳、马冬梅、朱华平等发明的“鉴别尖塘鳢鱼种的SNPs及基于SNPs的AS-PCR引物组及其检测方法及应用”获得国家发明专利授权，专利号：ZL202011292975.8。
旨在研究猪RXRB基因多态性位点，并筛选与猪生长育肥和繁殖性状显著相关的SNPs，为种猪的遗传改良提供新的遗传标记位点。本研究通过采集962头健康大白猪（美系大白459头，法系大白503头）的血液DNA，利用直接测序法和PCR-RFLP技术分别检测两个品系大白猪RXRB基因SNP位点，并进行遗传多态性分析。利用SAS 8.0软件中的混合线性模型（Mixed）对RXRB基因SNP位点与表型性状值进行...
旨在克隆和分析水貂酪氨酸酶（tyrosinase，TYR）基因编码区，揭示该基因编码区SNPs及其皮肤组织mRNA差异表达规律与水貂毛色表型的关系。本研究采集7月龄雄性金州黑水貂、名威银蓝水貂和红眼白水貂共计301个样本的血液，利用聚合酶链式反应（PCR）方法对水貂TYR基因5个外显子进行分段克隆，并拼接获得其完整编码区序列（coding sequence，CDS）；采用PCR产物直接测序技术筛查...
为获取缢蛏ScHsc70基因单核苷酸多态性位点与耐高温性状的相关性，通过直接测序方法克隆了ScHsc70基因全长序列，长度为4 048 bp，包括6个内含子和7个外显子，编码区1 950 bp，从其外显子区域筛查到6个潜在的SNPs，分别命名为Rs1(g. 588 C>T)、Rs2(g. 840 C>T)、Rs3(g. 885 T>A)、Rs4(g. 1233 A>G)、Rs5(g. 1467 T...
本研究旨在探索新疆褐牛产奶性状相关候选基因多态性与泌乳性状及体细胞评分(SCS)的相关性，探究新疆褐牛多态性位点的群体遗传特征。基于课题组前期DNA混池重测序的结果筛选17个SNPs突变信息，并采用基质辅助激光电离解吸飞行时间质谱法(Sequenom MassArray Genotype)分型技术验证FASN、FSHR、HAL、GPIHBP1、NIBPL、C9、PDE9A、PTK2、STAT1、Z...
Imputation accuracy of bovine spongiform encephalopathy-associated PRNP indel polymorphisms from middle-density SNPs arrays
BSE cattle indel prion gene
2015/7/3
Statistical methods of imputation allow predicting genotypes of markers (which were not genotyped in the whole population) based on known linkage disequilibrium relationships between the flanking poly...
Identification of SNPs in ME1 gene and association analysis with meat
candidate gene polymorphism beef
2015/7/2
The objective of this study was to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) in coding regions of bovine ME1 gene and to evaluate if the polymorphisms are associated with meat quality traits in ...
Novel SNPs of the porcine TRIP12 are associated with water holding capacity of meat
E3 ligase swine drip loss expression ubiquitination protein degradation meat quality
2015/6/24
Degradation of proteins during maturation of meat, mediated by the calpain/calpastatin system and the ubiquitination system, largely affects the tenderness and the water holding capacity (WHC) of meat...
旨在检测刺鼠信号蛋白(Agouti signaling protein，Agouti)基因外显子2、内含子2、外显子3及部分内含子3的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms，SNPs)在不同毛色美洲水貂群体中的分布，探讨该基因变异与水貂被毛颜色表型的相关性。以金州黑水貂、吉林白水貂、银蓝水貂、咖啡水貂和珍珠色水貂共计430个样本的血液基因组DNA为模板，采用...
旨在探讨Myf5基因与鸡生长繁殖性状的关联性。本研究采用PCR-SSCP方法，检测Myf5基因在京海黄鸡群体中的多态性，并对这些多态位点进行单倍型关联分析。结果表明：在Myf5基因外显子处共检测到8个SNPs位点。在379只京海黄鸡的群体中形成了9种单倍型。最小二乘分析结果显示，在生长性状方面，单倍型组合H1H5对8和12周龄体重影响显著（P<0.05），单倍型组合H2H6则对12和14周龄体重影...
为筛选STAT3基因启动子区SNPs及研究其对启动子功能元件和体尺性状的影响。选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池，直接测序筛选SNP位点，PCR-RFLP进行验证和基因分型，并利用114头务川黑牛个体分析SNPs位点与8个体尺性状的相关性。结果表明：STAT3基因5′调控区存在7个新SNPs位点，分别为：G-449A、C-341A、A-322G、C-246A、G-240A、...
试验旨在研究IGF-Ⅰ基因调控绵羊生长发育的表达模式和其SNPs位点与生长性状的相关性，采用qRT-PCR技术检测绵羊的大脑、肌肉、皮肤、肝脏和心脏组织的IGF-Ⅰ基因在15、60、105、150、195和240 d等6个时间点的变化，利用SSCP技术分析IGF-Ⅰ基因的SNPs位点与生长性状的相关性。结果表明：5个组织在105 d时出现第1个表达拐点，15～105 d时肌肉、大脑和肝脏组织的表达...
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs)是生物基因组中最常见的遗传多态。SNPs作为新一代分子遗传选择标记，在遗传学和医学研究很多方面具有重要的作用。最近几年，国际上出现了一种基于生物信息学的发掘SNP新方法。本文对采用该方法进行SNPs筛查的各种策略及其发展现状作一介绍。