搜索结果: 1-15 共查到“生物工程 SNP”相关记录16条 . 查询时间(0.102 秒)
本发明属于生物技术领域，公开了中棉所70群体中与棉花纤维强度相关的一个QTL，位于陆地棉24号染色体，定位到6个SNP分子标记，定位到116个基因并对其中一些基因的表达模式进行了分析。本发明还公开了一种与棉花相关的QTL的应用，该QTL和SNP分子标记可用于分子标记辅助选择育种，显著提高强度纤维品系的选择效率，为进一步提高纤维品质提供了一种最经济有效的分子育种新途径。
中国科学院昆明分院不同参考基因组对RAD-seq分析中SNP Calling的影响（图）
基因 分析 群体进化
2024/5/26
随着新一代测序技术兴起，基于酶切的简化基因组测序（Restriction-site associated DNA sequencing，RAD-seq）由于不受参考基因组的限制，成为快速获取生物高密度单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）的主流手段，被广泛运用于变异检测、遗传图谱构建、功能基因挖掘、群体进化分析等研究中。尽管在RAD-seq分析中对S...
随着新一代测序技术兴起，基于酶切的简化基因组测序（Restriction-site associated DNA sequencing，RAD-seq）由于不受参考基因组的限制，成为快速获取生物高密度单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）的主流手段，被广泛运用于变异检测、遗传图谱构建、功能基因挖掘、群体进化分析等研究中。尽管在RAD-seq分析中对S...
中国农业科学院棉花研究所专利：与陆地棉枯萎病抗病相关的SNP分子标记及其应用
陆地棉 枯萎病 抗病性 SNP分子标记
2024/4/15
本发明公开了与陆地棉枯萎病抗病相关的SNP分子标记及其应用。本发明首先公开了检测棉花基因组中SNP标记的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测棉花对枯萎病抗性中的应用；所述SNP标记为位于棉花基因组D03号染色体第2259240位核苷酸，其核苷酸种类为A和C。本发明进一步公开了鉴定或辅助鉴定待测棉花对枯萎病抗性的方法。本发明所提供的SNP标记可用于棉花枯萎病抗病性的早期预测，还可以用于棉花遗传背...
本发明属于植物基因工程技术领域，具体公开了棉花基因及其SNP标记在调控棉花果枝节间长度中的应用。本发明提供棉花基因在调控棉花果枝节间长度中的应用，同时提供与所述棉花基因相连锁的SNP标记及其应用。通过将棉花中所述棉花基因进行过表达或基因敲除来改变棉花果枝节间长度；同时利用本发明提供的SNP标记进行分子标记辅助选择，达到检测棉花果枝节间长度和育种的目的。本发明对培育适合机械采收和轻简化栽培的棉花品种...
国际上首个橡胶草高密度SNP遗传图谱构建
天然橡胶 工业原料 三叶橡胶树 橡胶草
2023/7/4
天然橡胶是世界四大工业原料之一，巴西三叶橡胶树一直是天然橡胶的主要来源，但由于种植面积限制、生产成本增加、遗传背景狭窄和病虫害严重等因素，橡胶生产逐渐难以满足需求。因此，开发生产天然橡胶的替代资源具有重要的战略意义和经济价值。
旨在探究DCT基因启动子区甲基化水平和SNP突变对山羊毛色的影响，为探索DCT基因调控山羊毛色变化的机理提供理论依据。本研究以山羊为试验动物，对DCT基因启动子区进行CpG岛预测，设计引物对预测的2个CpG岛富集区域进行亚硫酸氢盐甲基化测序，使用甲基化水平分析软件BISMA统计甲基化位点，比较唐山奶山羊（白色）和南江黄羊（黑色品系）两种不同毛色山羊群体DCT基因启动子区甲基化水平差异。克隆DCT基...
基于SNP标记的桃矮化基因精细定位
桃 矮化基因 SNP 精细定位
2017/11/9
矮化型桃树体矮小、节间短，是盆栽观赏和砧木育种的重要遗传资源。明确矮化性状形成的遗传机制并对桃矮化基因进行精细定位，是建立目标性状分子辅助选种体系和遗传改良的前提，可为有目标的选育矮化观赏桃和砧木品种奠定基础。【方法】以‘05-2-144’（‘97矮’ב鸳鸯垂枝’桃）套袋自交获得的395个后代单株构建的分离群体为材料。参考桃基因组信息并基于Sanger技术开发的SNP标记对亲本和后代单株进行分析...
旨在解析中国地方犬全基因组拷贝数变异（CNV）分布情况，为分析CNV对犬表型变异的影响提供前期基础。本研究采集了16个来自中国不同地方犬品种和9头罗威纳犬共计185头犬的血液样品，使用血液DNA提取试剂盒提取DNA，利用犬170 K SNP芯片和PennCNV软件对中国地方犬进行全基因组范围内的CNV分析。参照Illumina芯片标准操作流程进行芯片扫描和基因分型。将质控后的SNP参考PennCN...
本试验旨在研究猪ZP4基因的SNP在群体中的选择压及其与产仔数的关联性。收集大白猪、长白猪、长大二元猪3个群体共计328头母猪的产仔数记录，利用直接测序法克隆ZP4基因中的SNP位点，采用广义显性模型分析ZP4基因SNP与产仔数的关联性。采用lositan软件，Tajima's D检验和Fu and Li's D检验来检测ZP4的选择压。结果发现，ZP4中共检测到27个SNPs，关联分析表明A26...
SNP genotyping and population genomics from expressed sequences – current advances and future possibilities
SNP genotyping population genomics
2015/12/11
With the rapid increase in production of genetic data from new sequencing technologies,
a myriad of new ways to study genomic patterns in nonmodel organisms are currently
possible. Because genome as...
采用PCR-SSCP方法对种公牛群体雄激素受体(AR)基因5′ 非翻译区(5′UTR)多态性进行检测。结果表明:AR基因5′UTR含有多态性位点;测序结果显示5′UTR的-1 575处存在T→G碱基突变;用最小二乘方法对该基因型与生产性状相关分析显示遗传多态性与精子密度性状呈显著相关,AA型显著高于AB型(P=0.025),对其他性状的影响差异不显著。试验为研究种公牛体内AR基因的生物学作用奠定了...
鸡8个功能基因5′-侧翼区与内含子的SNP多样性比较
鸡 5′-侧翼区 SNP 适应性
2009/9/22
本研究旨在探讨鸡功能基因5′-侧翼区的单核苷酸多态性(SNP)水平。作者以白来航鸡、隐性白洛克鸡、杏花鸡、丝羽乌骨鸡、固始鸡、红色原鸡为材料, 扩增了GH、DDBC1、RIKEN、RASGRP3、IGF1、THRSP、VIP及PRL共8个基因的5′-侧翼区DNA序列。扩增序列全长为8,399 bp, SNP的总数为161个, 平均每52 bp出现一个SNP。8个功能基因5′-侧翼区核苷酸多样性的θ...
基于凝胶基因芯片的SNP检测平台
SNP 检测平台 基因芯片
2008/11/13
将丙烯酰胺修饰的核酸与丙烯酰胺单体、过硫酸铵等混合后点样于丙烯酰胺修饰的玻片上，然后置于真空，在引发剂气化的氛围下促其发生聚合反应形成凝胶并固定于玻片上。通过该方法，不仅可以固定合成的、修饰有丙烯酰胺的寡核苷酸及其类似物，还可以固定修饰了丙烯酰胺的PCR产物。这种在凝胶内三维的固定量比平面的固定量成指数级的提高。杂交后，用电泳替代传统的清洗方法，可以更好地提高信噪比和有效地区分完全匹配的序列和错配...